تأسس جنوب السودان عندما انفصل عن السودان فى استفتاء شعبى لسكان الجنوب، أعلن عن نتائجه النهائية فى فبراير 2011، وتم الإعلان عن استقلال كامل الدولة فى 9 يوليو 2011.تاريخ جنوب السودان لا يعرف عنه إلا القليل قبل عام 1820، عندما بدأ الكثير من الأوروبيين رحلاتهم لاكتشاف منابع النيل، خلال فترة الحكم التركى، قبل عام 1885 عيّن الخديو «حاكم مصر» بعض الأوروبيين كمديرين للمحافظات الاستوائية لخدمة أغراضه ومد نفوذه.وقد اشتهرت فترة الحكم التركى وفترة حكم المهدية 1885 - 1899 بغارات جلب الرقيق التى قام بها بعض الأوروبيين وأهل شمال السودان مما نجم عنه شعور زائد بالكراهية وولّد خوفًا شديدًا تجاه الشماليين.. معظم سكان الجنوب كانوا لا دينيين وقد بدأت الإرساليات المسيحية عملها فى الجنوب منذ عام 1848 وتم زيادة نشاطها وتنظيمها بعد عام 1899. فى إحصاء رسمى قديم نجد أن الكتاب السنوى للتبشير فى عام 1981 والذى يصدره مجلس الكنائس العالمى يقرر أن 2٪ من أهالى الجنوب "وثنيون لا يؤمنون بأى دين"، والبقية 18٪ مسلمون و80 ٪ مسيحيون "كاثوليك أو إنجيليين".