بدأت عمادة الدراسات العليا بالجامعة الإسلامية في المدينة المنورة، القبول في برامج الدراسات العليا للعام الجامعي 1440 / 1441 هـ، وذلك عبر البوابة الإلكترونية للعمادة ولمدة أسبوعين. وذكرت عمادة الدراسات العليا، أن البرامج المتاحة جميعها من برامج التعليم الأساسي الصباحي في كليات "الشريعة والدعوة وأصول الدين والقرآن الكريم والدراسات الإسلامية والحديث الشريف واللغة العربية".