أكّدت الأمانة العامة لهيئة كبار العلماء، أنَّ الحكم في المملكة العربية السعودية يستمد سلطته من كتاب الله وسنة رسوله، لافتةً إلى أنهما الحاكمان على جميع أنظمة الدولة. وفي الوقت ذاته شددت هيئة كبار العلماء، على استقلال السلطة القضائية في المملكة، ولا سلطان عليها سوى الشريعة الإسلامية. وقالت الهيئة، في بيان لها: "تابعت الأمانة العامة لهيئة كبار العلماء بيان النائب العام الذي أوضح الخطوات والإجراءات التي اتخذتها النيابة بقضية المواطن جمال خاشقجي حتى هذه اللحظة، مما يؤكّد أن الجهاز العدلي القضائي بالمملكة ماضٍ في تحقيق العدالة ومحاسبة أي متورط في هذه الجريمة". وأضافت الهيئة، أنَّ نظام العدالة بالمملكة يكفل الحقوق، ويتوخى الحق، ويعاقب أي معتدٍ بالجزاء العادل المقرر شرعًا ونظامًا.