وضعت وزارة التعليم العالي والبحث العلمي، خطة لتطوير المستشفيات الجامعية، كما حرصت الوزارة على كشف التحديات التي تواجه تحقيق التطوير، من أجل معالجتها ضمن خطة التطوير.وحددت الوزارة ضمن استراتيجية تطوير الستشفيات الجامعية ثلاثة تحديات، وهي الأوضاع والظروف الاقتصادية غير المستقرة، والروتين الحكومي، إلى جانب قصور وضعف التمويل.من ناحية أخرى وضعت الوزارة آليات لتطوير أداء المستشفيات الجامعية، من خلال ميكنة العمل بالمستشفيات الجامعية، التوسع في تقديم الخدمات الطبية والتعليمية والبحثية، وكذلك توفير وخلق فرص عمل جديدة تخدم المنظومة.وتستهدف خطة التطوير، تدريب الجهاز الطبي والإداري بالمستشفيات الجامعية، وزيادة عدد الأطباء، وكذلك زيادة عدد المستفيدين من الخدمات الطبية، من 17 مليونا إلى 18 مليون مريض، و3 ملايين مريض طوارئ.