قال الدكتور جمال مصطفى، مدير قطاع الآثار الإسلامية والقبطية بوزارة الآثار، إن مسجد "صرغتمش" متواجد في منطقة منخفضة، وهذا تسبب في تسلل الصرف الصحي للمسجد؛ موضحا أن وزارة الآثار قامت بترميم مسجد "صرغتمش" وإعادته لطبيعته في عام 2002. وأضاف "مصطفى"، خلال مداخلة هاتفية مع الإعلامي أسامة كمال، ببرنامج "مساء dmc"، المذاع على "dmc"، أنه عقب الترميم سقطت إحدى الدعائم الرئيسية في المسجد، وتم إخلاء جزء من المسجد بسبب تسلل الصرف الصحي مرة أخرى، وهذا يرجع إلى أن المسجد موجود في منطقة منخفضة نسبيًا. وتابع أن وزارة الآثار تعمل بخطة سنوية، وفي هذا الإطار سيتم ترميم 300 مسجد أثري في عام 2019 من بينهم مسجد "صرغتمش".وأشار "مصطفى"، إلى أن وزارة الأوقاف من المفترض أن تقوم بتمويل هذه ترميم المساجد الأثرية، ولكن نتيجة تعثر الأوقاف في تمويل بعض المساجد يتم العمل من ميزانية الأثار.