تفقد الشيخ حسين خلف الله بالإدارة العامة لشئون القرآن الكريم بقطاع المعاهد الأزهرية، سير الدراسة، بمعاهد منطقة الأقصر الأزهرية وهي الكرنك الإعدادي ونجع الطويل الإعدادي الثانوي وفتيات البعيرات وفتيات الأقصر الإعدادي الثانوي والشيخ الطيب الابتدائي.واطمأن خلف الله، سير الدراسة بهذه المعاهد وطالب بضرورة التزام المعلمين بالمناهج الدراسية وعدم الخروج عنها والحديث عن أي شيء يخالف المنهج الدراسي، واستوفى تقارير مفصلة عن أعداد الطلاب ونسبة الحضور والغياب ونسبة العجز في المعلمين وتسليم الكتب للطلاب بهذه المعاهد.وأكد خلف الله، على أن التعليم الأزهري يشهد طفرة تعليمية كبيرة لم يشهدها من قبل، تتمثل في تعديل وتخفيف المناهج الأزهرية بما يتناسب مع التطورات العصرية والوسائل التكنولوجية الحديثة التي تتناسب مع العصر الذي نعيش فيه، مقدَّما شكره للدكتور خليفة محمد إبراهيم رئيس الإدارة المركزية وأحمد على أحمد مدير الامتحانات وعبد الحليم عبد اللاهي مدير شئون القرآن الكريم للجهود المبذولة للوصول لهذا المستوى المتميز في البنية الأساسية والتعليمية.