أكد مصطفى إسماعيل الأمين العام ورئيس الجمعية الشرعية الرئيسية لتعاون العاملين بالكتاب والسنة المحمدية، أن علاقة الجمعية بمؤسسات الدولة على أعلى مستوى، مشيرا إلى أنه يتم التنسيق مع وزارة الخارجية فيما يخص القوافل الطبية بدول وادي النيل، وكذلك الأزهر الشريف الذي يعد المرجعية الدينية، وذلك انطلاقا من التوازن والاحترام المتبادل. وقال إسماعيل خلال المؤتمر الصحفي على هامش المؤتمر الدولي الثالث للأطفال حديثي الولادة بقاعة مؤتمرات الأزهر، "نحن المدرسة التي صدرت للأوقاف مشروع الخطبة الموحدة، وجميع ائمتنا ملتزمون بشهادة الأوقاف" وأضاف أن الجمعية لا ترى أي مشكلة في ولاية الأوقاف لمساجدها.وأكد أن جميع التبرعات تأتي من الداخل، حيث إن الجمعية لا تقبل التمويل الخارجي، مشيرا إلى علاقة الجمعية الطيبة بالإخوة المسيحيين.