أكد خبراء الصحة أهمية تعزيز ميكروبيوم الأمعاء الصحي من خلال تناول كوب قهوة في الصباح كونه يحتوي على نسبة عالية من السكر والدهون، مشيرين إلى أن القهوة السوداء مفيدة لصحة الأمعاء، بشرط عدم الإفراط في تناولها، وفق المجلة الأمريكية لأمراض الجهاز الهضمي حيث إنه تبين بتحليل عينات ميكروبيوم الأمعاء المأخوذة أثناء تنظير القولون الروتيني ووجدت أن الأشخاص الذين شربوا فنجانين أو أكثر من القهوة يوميًا طوال العام الماضي كانت لديهم ملامح ميكروبيوم أمعاء أفضل من أولئك الذين تناولوا قهوة أقل أو بدون قهوة وفقًا لما نشره موقع «mindbodygreen». وأوصي الخبراء بتناول نظام غذائي متنوع وصحي يعتمد على النبات وغني بالألياف، والحد من تناول الأطعمة المعالجة بشكل مفرط والتي تحتوي على كميات كبيرة من السكر والدهون المضافة، داعين إلى الحد من التوتر، وممارسة التمارين الرياضية كونها تؤثر على تكوين ميكروبيوم الأمعاء.