تقوم وكالة الرئاسة العامة لشؤون المسجد النبوي الشريف ممثلة في إدارة المختبر بأخذ وتحليل ما يقارب 60 عينة يوميًا من مياه زمزم في كل المواقع بالمسجد للتأكد من سلامتها وضمان وصولها بشكل آمن للزوار.   وأوضحت إدارة المختبر ، وفقا لوكالة الأنباء السعودية (واس)، أن العينات يتم أخذها من الحافظات والمشربيات والخزانات الأرضية والناقلات ونقاط التعبئة ومشربيات السبيل بالمسجد النبوي. ويجري ذلك بصفة منظمة ومستمرة على مدار اليوم من خلال 3 ورديات، ويتم عمل التحاليل اللازمة للتأكد من سلامتها وعدم تعرضها لأي ملوثات.