ولدت مسابقة كأس جلالة الملك المفدى ورأت النور في العاشر من ابريل 1978م تحت مسمى كأس الأمير المفدى لكرة القدم، وذلك بعدما حصل اتحاد الكرة الذي كان يترأسه الشيخ عيسى بن راشد على الموافقة السامية من المغفور له سمو الشيخ عيسى بن سلمان آل خليفة أمير البلاد آنذاك لتغيير مسماها من كأس الاتحاد (1959/1977م) إلى مسمى سموه رحمه الله. النسخة الأولى وشهدت النسخة الأولى (1978/1979م) مشاركة خمسة عشر ناديا وهم الأهلي، والقادسية، والمحرق، والرفاع الشرقي، والحالة، والتضامن، ورأس الرمان، والبديع، وشط العرب (اندمج مع البحرين)، والحد، والتاج (المنامة حاليا)، والجزائر (اندمج مع الأهلي)، والوحدة (النجمة حاليا)، والرفاع الغربي، والبحرين. وجاءت نتائج الدور التمهيدي من المسابقة بفوز الأهلي على القادسية (3/2)، والمحرق على الرفاع الشرقي (3/صفر)، والحالة على التضامن (3/صفر)، ورأس الرمان على البديع (2/1)، وشط العرب على الحد (2/1)، والتاج على الجزائر (3/صفر). وفي الدور الثاني فاز البحرين على الأهلي (1/صفر)، والمحرق على الحالة (1/صفر)، وقبلها فاز الحالة على الرفاع الغربي (4/3)، ورأس الرمان على شط العرب (4/2)، والوحدة على التاج (4/0)، والمحرق على التاج (4/صفر)، وفي نصف النهائي فاز المحرق على البحرين (2/1)، والوحدة على رأس الرمان (2/1). المحرق البطل.. وبوشقر الهداف وتسلم المحرق كأس النسخة الأولى من يد جلالة الملك حمد بن عيسى آل خليفة عاهل البلاد المفدى، حيث أنابه الأمير المغفور له عيسى بن سلمان آل خليفة بالحضور ممثلاً عنه، وكان جلالة الملك حينها وليًا للعهد ورئيسًا للمجلس الأعلى للشباب والرياضة، وفي ذلك اليوم فاز المحرق على الوحدة (النجمة حاليا) في المباراة النهائية بهدف دون رد حمل توقيع كابتن المحرق حسن عجلان، وشهدت المباراة تألق حارس المحرق حمود سلطان الذي صد ركلة جزاء قبل هدف عجلان نفذها لاعب الوحدة محمد الزياني. وتصدر لاعب فريق الوحدة فؤاد بوشقر قائمة الهدافين بتسجيله لـ5 أهداف من إجمالي 42 هدفا سجلت على مدار 14 مباراة أقيمت ضمن المسابقة التي لم تشهد ولا حالة التعادل واحدة في أي من مبارياتها. وفي موسم 2001/2002م تغير مسمى البطولة لتحمل اسم كأس الملك المفدى عقب تولي جلالة الملك حمد بن عيسى آل خليفة حفظه الله ورعاه مقاليد الحكم في المملكة. وفيما يلي سجل الأبطال التفصيلي لمسابقة كأس جلالة الملك المفدى بمسمياتها الثلاثة (كأس الاتحاد، وكأس الأمير، وكأس الملك) منذ موسم 1959/1960م وحتى الموسم الماضي 2013/2014م.