توعد المرشد الأعلى الإيراني آية الله علي خامنئي بإنزال "أشد  العقاب" بإسرائيل المتهمة باغتيال إسماعيل هنية في طهران.    وقال خامنئي في تصريحات نقلتها وكالة الأنباء الإيرانية الرسمية (إرنا) "بهذا العمل جر النظام الصهيوني المجرم والإرهابي على نفسه أشد العقاب.. ونعتبر من واجبنا الثأر لدماء (هنية) التي سُفكت على أراضي الجمهورية الإسلامية الإيرانية".   وأعلنت ايران الحداد ثلاثة ايام. من جهته، اتهم الرئيس الإيراني مسعود بزشكيان إسرائيل بالوقوف خلف اغتيال هنية متوعّداً بجعلها "تندم" على ذلك.