أهدت ثانوية الحسين بن علي الوطن عامةً ومكة المكرمة خاصة جائزة الشيخ حمدان بن راشد آل مكتوم الدولية لفئة المدرسة والإدارة المدرسية المتميزة . علماً بأن هذه الجائزة لهذه الفئة قد حجبت للعامين الماضيين عن المملكة العربية السعودية ، وهي المدرسة الأولى التى تحصد الجائزة في منطقة مكة المكرمة . ويميز ثانوية الحسين بن علي كادرها التعليمي المميز بقيادة الأستاذ عبدالله بن حباب النفيعي ونخبة من الإداريين ومعلمين أكفاء . الجدير بالذكر أن المدرسة سبق لها الحصول على جائزة التميز بالوزارة مرتين ، وكذلك المركز الأول على جائزة الشيخ عبدالصمد القرشي ، وكذلك تميز طلابها في إختبارات القدرات والتحصيلي على مستوى الوزارة في مركز قياس ، كل هذا حسب رؤية المدرسة الواضحة نحو الريادة والتميز على مستوى العالم العربي علمياً وخلقياً .