تعرض المسجد الأقصى إلى العديد من الانتهاكات منذ أن أقدمت اسرائيل على احتلال القدس الشرقية قبل نحو نصف قرن، وفيمايلي أبرز الانتهاكات التي تعرض لها الحرم القدسي الشريف منذ عام 1967 1967/6/7احتلال إسرائيل للقدس الشرقية ومن ضمنها المسجد الأقصى و رفع العلم الإسرائيلي على قبة الصخرة ومنع المصلين من دخول الأقصى 1969/8/21الأسترالي مايكل روهان يحرق المسجد الأقصى ومنبر صلاح الدين 1981/8/31تصدع الأبنية الملاصقة للمسجد الأقصى بسبب الحفريات الإسرائيلية 1982/4/11الجندي هاري غولدمان يقتحم مسجد قبة الصخرة ويقتل اثنين من المصلين ويجرح أكثر من 60 فلسطينيا 1990/8/10إسرائيل ترتكب مذبحة في المسجد الأقصى ذهب ضحيتها 23 فلسطينيا 1994/6الوقف الإسلامي يتهم إسرائيل بحفر نفق يهدد الآثار الإسلامية حول المسجد الأقصى 1996/9/27إسرائيل تقتحم مجمع الأقصى بعد فتح نفق تحت المسجد وتقتل ثلاثة من المصلين وتجرح أكثر من مئة فلسطيني 2000/9/28اقتحام زعيم حزب الليكود آرييل شارون المسجد الأقصى مما أدى إلى اندلاع الانتفاضة الفلسطينية الثانية 8-2-2006وزارة التربية والتعليم الاسرائيلية والوكالة اليهودية يوزعان آلاف النسخ لخرائط البلدة القديمة في القدس وضعت فيها صورة لمجسم الهيكل المزعوم مكان قبة الصخرة. 2017/7/14إغلاق المسجد الأقصى أمام المصلين ومنع رفع الأذان وإقامة الصلاة للمرة الأولى منذ احتلال القدس الشرقية