يمثل البرنامج الوطني للعناية بالمساجد العتيقة، أحد أبرز البرامج القائمة والفاعلة في حماية التراث العمراني؛ من خلال ما يشهده من مشاريع يجري تنفيذها -حاليا- في مختلف مناطق المملكة. ويهدف البرنامج إلى الحفاظ على المساجد التاريخية؛ نظراً لمكانتها العظيمة في الدين الإسلامي الحنيف، لتميز طابعها المعماري الأصيل؛ إضافة إلى كونها أحد أهم معالم التراث العمراني في المملكة العربية السعودية. وقد تبنى الأمير سلطان بن سلمان بن عبدالعزيز رئيس الهيئة العامة للسياحة والآثار، مؤسس ورئيس مؤسسة التراث الخيرية البرنامج الوطني للعناية بالمساجد العتيقة، في إطار اهتمام سموه بكل ما له صلة بخدمة بيوت الله، والتراث العمراني الإسلامي، حيث بدأت مؤسسة التراث الخيرية القيام بدورها في الاهتمام بالمساجد في المملكة العربية السعودية، وأخذت على عاتقها - منذ بداية إطلاقها للبرنامج عام1418هـ- أهمية توثيق وترميم عدد من المساجد العتيقة في جميع مناطق المملكة وقراها. وتعود فكرة إطلاق البرنامج الوطني للعناية بالمساجد العتيقة، إلى رؤية قدمها صاحب السمو الملكي الأمير سلطان بن سلمان ، بالتعاون مع معالي وزير الشؤون الإسلامية والأوقاف والدعوة والإرشاد الشيخ صالح بن عبدالعزيز آل الشيخ، إلى صاحب السمو الملكي الأمير سلطان بن عبدالعزيز، ولي العهد -رحمه الله- النائب الثاني لرئيس مجلس الوزراء، ووزير الدفاع والطيران والمفتش العام -آنذاك-، إذ تفضل سموه، بالموافقة على رعاية برنامج العناية بالمساجد، وإعادة بنائها وترميمها وتوثيق تاريخها، وذلك في 16 صفر سنة (1418هـ)، وقدم دعماً للمرحلة الأولى من البرنامج بمبلغ مليوني ريال، تم تخصيصها لمسح المساجد المرصودة، وصدر توجيه سموه، بعد نجاح البرنامج في ترميم عدد من المساجد؛ بإهداء ما تم إنجازه إلى الوزارة، وتسمية البرنامج بـ ( البرنامج الوطني للعناية بالمساجد العتيقة). وقد قامت مؤسسة التراث الخيرية، بمشاركة وزارة الشؤون الإسلامية والأوقاف والدعوة والإرشاد، بتنفيذ المهام المتعلقة بإنجاز هذا البرنامج، وفق خطة عمل دقيقة، حيث تم تقسيم العمل فيها إلى مراحل متعاقبة، ففي المرحلة الأولى، قامت وزارة الشؤون الإسلامية والأوقاف والدعوة والإرشاد بتزويد مؤسسة التراث الخيرية بمعلومات عن المساجد المعنية، وذلك من خلال ما يرد من فروع الوزارة في مناطق المملكة، وبدورها قامت مؤسسة التراث الخيرية باختيار المساجد ذات الخصوصية العمرانية المحلية، إضافة إلى قيامها باقتراح عدد من المساجد التي تتناسب مع معايير البرنامج، وذلك بإرسالها إلى الوزارة لاعتمادها، وضمها إلى قوائم المساجد المعتمدة التي سيشملها البرنامج. وقد بدأ العمل في هذا البرنامج، وتم مسح عدد من المساجد المهمة في مختلف مناطق المملكة، وتم توثيقها وتصويرها وإعداد تقارير مفصلة عن كل منها. ويتضمن هذا الإنجاز إنشاء قاعدة بيانات تضم جميع المعلومات والصور والرفع المساحي للمساجد التي سيشملها البرنامج، ويتم تحديث المعلومات المساحية العامة بشكل مستمر، وتساهم هذه القاعدة في التعريف بالبرنامج وبأهميته. وفي المنطقة الشرقية يوجد ستة مساجد بالمنطقة الشرقية، تم ترميمها بدعم من الهيئة الملكية للجبيل وينبع وهي: مسجد جواثا، ومسجد الحسن بالبطالية، ومسجد العقير بميناء العقير، ومسجد قرية التهيمية الأول، ومسجد قرية التهيمية الثاني، ومسجد حمد المجدل بجزيرة جنة، أما مسجد الجبري فقد رمم بدعم من الشيخ عبدالله الخطيب.