قال الشيخ محمود شلبي أمين الفتوى بدار الإفتاء، إن الإمام الشافعي يرى أن القنوت في الفجر سنة، ومحله يكون بعد الاعتدال من الركعة الثانية، وغير المذهب الشافعي يرون أنه لا قنوت في الفجر.من ناحية أخرى، أكد الدكتور على جمعة، مفتى الجمهورية السابق، أن دعاء القنوت فى الفجر سنة عند الإمام الشافعي وينبغي على المسلم عدم تركه ومن تركه لزمه سجود السهو، لافتًا إلى أن المصريين معظمهم ينتهجون مذهب الإمام الشافعى لأنه عندما مات دفن فى مصر.وأوضح "جمعة"، في فتوى له، أن الأئمة الآخرين أبوحنيفة ومالك وابن حنبل يقولون إنه غير سنة وكثيرًا ما تركه النبى -صلى الله عليه وسلم-، مشيرًا إلى أن الأمر بسيط لوجود الخلاف فيه.