تتربع محمية "الخنفة" على مساحة تقدر بـ 19 ألف كيلو متر مربع شمال محافظة تيماء التابعة لمنطقة تبوك، بمحاذاة صحراء النفوذ الكبير من الجهة الغربية، متضمنة العديد من المرتفعات والتلال ذات المناسيب المختلفة.     ومن أبرز تلك المرتفعات والتلال: الضاحكية، وجبال عنز، وضبع، وبنية نيال، وأبو طليحات، والجرانيات، وبغيث الأسمر.     ومحمية الخنفة عبارة عن تكوينات رسوبية تتمثل في تكوين تبوك الرئيس، ويشتمل على حجر الرمل الكوارتزي بلون أشقر وبني فاتح ورمادي وبني مائل إلى الحمرة، ونادرا بلون أبيض يتحول إلى البني الغامق حتى الأسود.     وتضم العديد من الشعاب والأودية، منها وادي فجر ويقع في شمال المحمية، ووادي نيَال وهو المصرف الرئيس للجزء الأوسط والجزء الجنوبي الشرقي من المحمية، ووادي العقيلة وروافده ووادي الفاطر وروافده.      وتغذي وادي نيِال روافد تسيل من الشمال من جبال بغيث الأحمر والأسمر كوادي السايلة، وروافد من الجنوب من جبال غرب كوادي غرب ومن جبال الخنافرية، بالإضافة إلى وادي الموردة الذي يجري من الجنوب للشمال ووادي أبو مطايا.     وتزخر المحمية بكمية أمطار موسمية تتراوح ما بين 50 إلى 100 ملليمتر، نمت على أثرها أشجار الطلح والأرطى والغضى الذي ينتشر في المناطق الرملية منها مثل: عريق الحلوات والمظاهير والمكيحيل وصحراء النفود الكبير, علاوة على أشجار العوسج والأثل والعرفج والرمث والحوا والصمعا والنصي والحميض والخزامى والربلة والشبرم .   وفي تصريحات مدير المحمية نايف بن مسحل العتيبي، لوكالة "واس" قال  إن سبب إنشاء المحمية يعود لخطط الحكومة في التصدي للأخطار المحدقة بالحياة الفطرية في أنحاء المملكة، وإعادة تأهيل أنواع الكائنات الحية والبحرية التي انقرضت والمهددة بخطر الانقراض لضبط التوازن البيئي للنظم البيئية الطبيعية.      وأشار العتيبي إلى أن الهيئة السعودية لحماية الحياة الفطرية تعمل على تطوير آلية العمل بإدارة المحمية، من خلال تطوير برنامج رصد مدعم بكاميرات مراقبة للحياة الفطرية والعمل على توفير بيئة مناسبة للعاملين والزوار بإنشاء مبنى إداري جديد للمحمية يتميز بموقعه المناسب للإشراف على كافة الأعمال التي تقوم بها الهيئة داخل المحمية .      وعن الإجراءات اللازمة للحصول على ترخيص دخول للمحمية أفاد العتيبي أنه يتطلب من الراغب في زيارة المحمية تعبئة النموذج الخاص بالزيارات الموجود على موقع الهيئة الإليكتروني, وإرساله إلى فاكس رقم 0114422166 قبل موعد الزيارة بأسبوعين.