برغم فوائد التونة الصحية إلا أنها ممنوعة في مجموعة من الحالات وضحها دكتور حازم المصرى أخصائى التغذية فى المركز المصرى البريطانى لعلاج السمنة، وأشار إلى أن أقصى استخدام للتونة عبوة أو اثنتين خلال الأسبوع ويفضل استخدام التونة اللايت كما يفضّل التخلص من السوائل الموجودة فى العلبة.وأشار لتقرير منظمة الغذاء والدواء أن بعض الناس لا يناسبهم تناول التونة بشكل منتظم مثل الأشخاص الذين يعانون من حساسية الأسماك حيث أنه عالي في محتواه من الهيستامين، والحوامل والمرضعات والأطفال و أي شخص لديه مشكلة في المناعة لأن التونة تحتوي على نسب من الزئبق وهو عنصر معدني لة أثار جانبية علي الجهاز العصبى.