وقالت وزارة الطيران المدني المصرية إن سبب الحادث يعود إلى وجود عطل فني في قنوات الاتصال بين نظام الحجز العالمي المتعاقد عليه ونظام إنهاء إجراءات السفر داخل المطار. هذا وتم على الفور تشكيل فريق عمل مكون من جميع الجهات الفنية المتخصصة للتعامل مع الموقف وتقديم كافة التسهيلات اللازمة للركاب. من جانبها اعتذرت إدارة مطار القاهرة عن أي تأخير قد ينتج عن هذا العطل فيما أبدى بعض المسافرين امتعاضهم من تعطل الأنظمة وعدم وجود نظام بديل لمثل هذه الحالات.